Die erste Botschafterin des am 21. März 1990 unabhängig gewordenen Namibia, Frau
Nora Schimming-Chase, überreichte am 09. Juli 1992 dem damaligen Bundespräsidenten Richard von Weizäcker ihr Akkreditierungsschreiben.
Die Botschaft wurde Mitte 1991 durch den Geschäftsträger Joseph Jimmy in Bonn-Rüngsdorf eingerichtet und befand sich später bis zu ihrem Umzug nach Berlin in Bonn-Mehlem.
Nach Beendigung der vierjährigen Amtszeit von Frau Schimming-Chase folgte ihr im Sommer 1996 Botschafter Hinyangerwa P. Asheeke.
Während
Botschafter Asheekes Amtszeit zog die namibische Botschaft als eine der ersten diplomatischen Vertretungen anlässlich des Regierungsumzugs im August 1999 nach Berlin-Tiergarten.
Nach einer siebenjährigen Botschaftertätigkeit in Deutschland mit Akkreditierung in Österreich, verließ Botschafter Askeeke Berlin im Sommer 2003.
Ihm folgte Botschafter Hanno Rumpf, der bis zum Sommer 2006 die Botschaft in der Berliner Wichmannstrasse leitete.
Botschafter Rumpf tauschte seinen Posten im Sommer 2006 mit Botschafter Prof. Peter H. Katjavivi, der aus Brüssel nach Berlin kam.
Während Prof. Katjavivis Amtszeit erwarb Namibia ein eigenes Botschaftsgebäude im Berliner West-End.
Aufgrund seiner Berufung zum Generaldirektor der National Planning Commission (NPC) im Mai 2008 (Ende der Amtszeit 21. März 2010), beendete Prof. Katjavivi frühzeitig seine Botschaftertätigkeit in Deutschland.Seit März 2010 ist Prof. Katjavivi Franktionsvorsitzender der regierenden SWAPO Partei im Parlament.
Am 13. Januar 2009 überreichte Botschafter Neville Gertze (lk) Bundespräsident Dr. Horst Köhler (re.) sein Akkreditierungsschreiben und war der fünfte akkreditierte Botschafter der Republik Namibia in der Bundesrepublik Deutschland sowie zweiter akkreditierter Botschafter beim Heiligen Stuhl und der Republik Türkei. Am 26. Januar 2010 überreichte Botschafter Gertze dem Präsidenten der Republik Polen, Lech Kaczyński, sein Akkreditierungsschreiben. Damit wurde Botschafter Gertze Namibias erster akkreditierter Botschafter in der Republik Polen.
Am 10. Februar 2015 wurde Botschafter Gertze abberufen. In Namibia bekleidet er nun den Posten des Protokollchefs.